Programming languages for bioinformatics
Keywords:
Programming languages, bioinformatics, digitalAbstract
Today, with the advancement of computer science, communication networks, and new laboratory techniques, we can have a large amount of information in digital format. In the case of biology, there are many databases that store information from biological experiments, and experiments are being carried out with devices that can return a large amount of information in computer files, such as next-generation sequencers and microarray experiments.
Downloads
Metrics
Publication Facts
Reviewer profiles N/A
Author statements
Indexed in
-
—
- Editor & editorial board
- profiles
- Academic society
- N/A
- Publisher
- Uma Editorial. Universidad de Málaga
To learn about these publication facts, click 
PF is maintained by the Public Knowledge Project
References
Falgueras J., et al. SeqTrim: a high-throughput pipeline for preprocessing any type of sequence reads BMC Bioinformatics 2010, 11:38
Goto et al. BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language. Bioinformatics 2010, 26(20):2617-9
Cock et al. Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics. Bioinformatics. 2009, 25(11):1422-3
Fourment M. and Gillings M.R. A comparison of common programming languages used in bioinformatics. BMC Bioinformatics 2008, 9:82
Stajich JE. An introduction to BioPerl. Meth Mol Biol 2007, 406:535-48
Downloads
Published
How to Cite
Issue
Section
License
Esta obra está bajo licencia internacional Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0.
Esta revista provee acceso libre inmediato a su contenido bajo el principio de hacer disponible gratuitamente la investigación al público. Todos los contenidos publicados en Encuentros en la Bilogía están sujetos a la licencia Creative Commons Reconocimento-NoComercia-Compartirigual 4.0 cuyo texto completo puede consultar en <http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0>
Se pueden copiar, usar, difundir, transmitir y exponer públicamente, siempre que:
Se cite la autoría y la fuente original de su publicación (revista, editorial y URL de la obra).
No se usen para fines comerciales.
Se mencione la existencia y especificaciones de esta licencia de uso
Los derechos de autor son de dos clases: morales y patrimoniales. Los derechos morales son prerrogativas perpetuas, irrenunciables, intransferibles, inalienables, inembargables e imprescriptibles. De acuerdo con la legislación de derechos de autor, Encuentros en la Biología reconoce y respeta el derecho moral de los autores/as, así como la titularidad del derecho patrimonial, el cual será cedido a la Universidad de Málaga para su difusión en acceso abierto. Los derechos patrimoniales, se refieren a los beneficios que se obtienen por el uso o divulgación de las obras. Encuentros en la Biología se publica en open access y queda autorizada en exclusiva para realizar o autorizar por cualquier medio el uso, distribución, divulgación, reproducción, adaptación, traducción o transformación de la obra.
Es responsabilidad de los autores/as obtener los permisos necesarios de las imágenes que están sujetas a derechos de autor.
Los autores/as cuyas contribuciones sean aceptadas para su publicación en esta revista conservarán el derecho no exclusivo de utilizar sus contribuciones con fines académicos, de investigación y educativos, incluyendo el auto-archivo o depósito en repositorios de acceso abierto de cualquier tipo.
La edición electrónica de esta revista esta editada por la Editorial de la Universidad de Málaga (UmaEditorial), siendo necesario citar la procedencia en cualquier reproducción parcial o total.
